Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms