Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Shroom4Q1W617 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
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