Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Trim71Q1PSW8 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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