Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms