Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms