Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Spta1P08032 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Spta1P08032 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms