Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Nedd9O35177 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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