Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Spocd1B1ASB6 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms