Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col4a3Q9QZS0 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Col4a3Q9QZS0 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col4a3Q9QZS0 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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