Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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