Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms