Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn12Q9ET43 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn12Q9ET43 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms