Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms