Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccdc47Q9D024 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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