Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms