Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hdac9Q99N13 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms