Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Apobec3Q99J72 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Apobec3Q99J72 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Apobec3Q99J72 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Apobec3Q99J72 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Apobec3Q99J72 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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