Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms