Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Chsy3Q5DTK1 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms