Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms