Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms