Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms