Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms