Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TspoP50637 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TspoP50637 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TspoP50637 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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