Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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VdrP48281 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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VdrP48281 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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VdrP48281 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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VdrP48281 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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VdrP48281 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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VdrP48281 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
VdrP48281 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
VdrP48281 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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