Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rpl28P41105 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms