Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cd28P31041 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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