Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
DffaO54786 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
DffaO54786 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DffaO54786 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DffaO54786 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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