Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nedd9O35177 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Nedd9O35177 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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