Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ArxO35085 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
ArxO35085 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ArxO35085 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ArxO35085 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms