Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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