Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms