Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc6D3YZP9 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms