Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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Grik3B1AS29 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Grik3B1AS29 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Grik3B1AS29 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms