Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rtf1A2AQ19 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Rtf1A2AQ19 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rtf1A2AQ19 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rtf1A2AQ19 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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