Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
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