Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms