Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp5Q9Z131 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Sh3bp5Q9Z131 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Sh3bp5Q9Z131 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Sh3bp5Q9Z131 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms