Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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