Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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