Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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