Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Smim11aQ99J19 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Smim11aQ99J19 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms