Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp38Q8BW70 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms