Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NipblQ6KCD5 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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