Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trappc1Q5NCF2 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms