Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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