Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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