Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cd28P31041 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Cd28P31041 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cd28P31041 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cd28P31041 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cd28P31041 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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