Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PtprmP28828 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PtprmP28828 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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