Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Vpreb2P13373 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms